Het Slotermeer ligt ten noorden van de stad Sloten, ten oosten van Balk en ten zuiden van Woudsend. Vanaf het Slotermeer loopt het Slotergat naar Sloten, de Ee naar Woudsend en de Luts naar Balk. Het meer is buiten de vaargeulen soms maar 1,20 meter diep. Aan de oostkant naast de vaargeul is de waterdiepte ongeveer 1 meter.